褐藻和绿藻颜色不同，出现的时间也不同。褐藻通常是褐色的，在养鱼的早期容易出现。水中氨氮含量比较高，光照不够，所以这种藻类容易生长。但是绿藻的情况就不一样了，主要吸收硝酸盐，对光有一定需求。因此，鱼养得越久，绿藻就会越多。
绿藻多见于淡水，常附著於沉水的岩石和木头，或漂浮在死水表面;也有生活於土壤或海水中的种类，浮游种类是水生动物的食物或氧的来源。
绿藻的叶绿体被两层细胞膜包围着，所以有猜测说它们可能是直接由蓝菌的内共生而得来的。部份蓝菌有类似的色素沉着，但这似乎出现不只一次，而绿藻的叶绿体也不再被认为和此类型的关系相近。相对地，绿藻可能和红藻有着相同的祖先。
褐藻没有单细胞，全为多细胞植物，最简单的是由单列细胞组成的分枝丝状体。进化的种类，有类似根、茎、叶的分化，有的甚至具有气囊构造，如海带目可协助藻体漂浮在海面上，内部组织则有表皮、皮层及髓部之分化，体型普遍较为粗大，可长至60多公尺长，大量繁殖时形成海洋森林或藻海，吸引无数海洋生物汇集，带来丰富的海洋资源。
